蒙•莫斯瑪過世。
一個神秘的隕石撞擊在冰凍星球Helska IV上，並出現了一種自稱遇戰瘋且無原力作用的外星種族，對於其他種族採趕盡殺絕的態度，能夠將他人洗腦與控制，擅長生物遺傳科技並反機械科技。其中其實已經有兩個偽裝成Yomin Carr和Nom Anor的身分以作為引導。遇戰瘋在Sernpidal放置一只有機體重力井，使其衛星Dobido墜落。邱巴卡在幫助難民離開時因衛星擊中地表而喪生。新共和不敵遇戰瘋的蟲海艦隊侵略並發現巨大的生物世界艦﹝worldship﹞。新共和與奇斯合作研究遇戰瘋的生物特性。Nom Anor在一次戰役敗亡，新的指揮官是Shedao Shai。
婕納加入俠盜中隊。
Elegos AK'la出使外交任務到遇戰瘋卻被殺。遇戰瘋繼續從外環星域推進，莉亞尋求裴列恩的支援。Shai攻打Ithor。柯蘭與Shai單挑並將對方殺死。Ithor被毀滅。新共和抨擊絕地武士。Kyp一度因為黑暗面傾向被驅逐。
在奇斯率領戰機大隊的費爾男爵之子賈格•費爾﹝Jagged Fel﹞加入俠盜中隊幫忙。
遇戰瘋資助一個稱為和平旅﹝Peace Brigade﹞的傭兵團體。
絕地武士前往銀河各地偵查遇戰瘋的入侵情形。此時已經有約三十個星系落入遇戰瘋手中。新共和頒布銀河徵兵法令，所有的造船廠都以加倍速度生產。新共和戰機裝配能辨識 遇戰瘋戰機的新型感測器。遇戰瘋預備攻擊科羅森，嚴重威脅銀河核心地區，而新共和情報局發現內有叛徒幫助遇戰瘋。蒙•克萊梅利被封鎖。薩瑞肯•薩─蘇洛被釋放來幫助新共和修復中端站。
遇戰瘋艦隊攻擊Fondor的造船廠，而薩─蘇洛以中端站的火力朝Fondor射擊，削掉大半海奔艦隊與遇戰瘋艦隊，並炸掉Fondor的衛星，共和、絕地、海奔與赫特都落入分裂狀態。絕地武士逐漸被共和排斥。
路克在Lah的通牒下決定發動全力反擊。和平旅打算進攻絕地學院，絕地學院開始撤離。遇戰瘋在絕地學院原址建立龐大的生化工程中心。安那金被一位名為Vua Rapuung的遇戰瘋協助﹝Shame One奴隸﹞並以奴隸身分混入遇戰瘋。遇戰瘋找到摩克星並改造當地能追蹤原力的馮克斯獸﹝Vornskrs﹞。遇戰瘋抓走安那金的絕地同伴塔赫莉﹝Tahiri﹞並將她改造為半遇戰瘋，希望學得原力以對抗絕地。安那金救出塔赫莉。Shame One開始認為絕地才是能救贖他們的人。
絕地在遇戰瘋佔領區建立地下運輸網路。瑪拉的病情日益惡化，後來產下兒子班﹝Ben﹞，不過病情最終痊癒。
絕地面對以馮斯克獸改造並被複製的絕地殺手voxyn。共和依舊傾向反絕地的態度，佛列亞甚至讓遇戰瘋進入參議院並與Nom會面，不過對方的態度讓他不得已轉而支持絕地。藍道開發能偽裝成 遇戰瘋並加以獵殺的YVH機器人，並參與阻止佛列亞被暗殺的行動。遇戰瘋準備進攻科羅森。遇戰瘋在科羅森以俘虜的難民船作為護盾並逼近地面，迫使貝爾•埃伯力斯對人質開火。佛列亞引爆辦公室的質子炸彈與許多 遇戰瘋同歸於盡。
一群絕地到摩克星探查情況並試圖殺死馮克斯獸母體。絕地突擊小組在摩克遭遇慘烈的戰鬥，安那金力戰身亡。在遇戰瘋以安那金屍體的挑釁下，婕納爆發憤怒而墮入黑暗面。傑森在逼近voxyn母體時被Nom俘虜 。
婕納意圖為兄弟復仇。傑森被來自舊共和並與遇戰瘋共處已久的絕地Vergere折磨並灌輸遇戰瘋擁抱痛苦的思想，並被植入為遇戰瘋的組織當奴隸經歷各地。傑森在Vergere的言語中體認到其實Vong並不是不存在原力，只是絕地無法感應到而已─他因此能和控制奴隸的一個dhuryam﹝世界腦的胚胎﹞溝通並合作。科羅森被改名Yuuzhan'tar。想成為英雄的Ganner Rhysode打算找到傑森。
路克和魏奇成立新反抗軍獨自與遇戰瘋對抗。遇戰瘋派出最高統帥Lah之父戰神Czulkang Lah來對付魏奇。凱普引導婕納返回光明面。
婕納與Jag相戀。魏奇實施心理戰讓對方轉移注意，以婕納作為心理戰的主角，並偽造一種配有超級雷射的超級武器 Starlancer的情報來嚇唬遇戰瘋。新的絕地基地設於Maw。路克和瑪拉在惡靈中隊幫助下率小組入侵科羅森並得知留在 科羅森地下深處的黑暗Nyax大君﹝其實是被改造的Irek﹞，Viqi率隊獵殺科羅森的絕地但是被迫與絕地合作對抗Nyax。魏奇在皇帝之槌﹝Emporor's Hammer﹞作戰中以露珊奇亞號摧毀遇戰瘋的地面部隊。魏奇在科羅森以假的Starlancer引誘Czulkang的艦隊攻擊，最後以露珊奇亞號等摧毀其世界艦。
剩餘的新共和參議院坐落於臨時首都蒙•克萊梅利。
Vergere察覺傑森對黑暗面的恐懼並解釋原力其實不分光明與黑暗，而是來自人心的選擇。傑森決定接受遇戰瘋的哲學。傑森遇到Ganner，兩人被遇戰瘋帶到世界腦 ﹝World Brain，掌管星球資源用﹞位於的銀河參議院。Ganner決定犧牲自己換取傑森的時間，力戰數千遇戰瘋。傑森在世界腦之中體認到萬物為一，並讓世界腦學習到「狂熱即自滅」的想法。Vergere與傑森逃出，並告訴傑森關於活行星Zonama Sekot與遇戰瘋的關聯。
韓和莉亞前往帝國疆域尋求幫助，裴列恩同意以帝國核心星域地圖作為Vong資料的交換。新共和與海奔聯手在歐伯拉─史蓋的大戰雖然大勝，但試圖殺死最高統帥Shimmra卻未成功﹝他隨後來到Yuuzhan'tar坐鎮﹞。路克決定重組由絕地和參議員混合組成的絕地議會。新的YVH鼠形機器人能發現偽裝的 遇戰瘋。年邁的亞克博重回部隊並在研究遇戰瘋後想出新戰術。
絕地武士加入艦隊作為協調作戰。位於Ylesia的和平旅總部成為新共和的首要目標。薩─蘇洛希望以條件交換科瑞利拉的統治權，卻被迫當上和平旅總統，與新共和總理﹝其實是被驅逐的親敵共和議員﹞簽訂條約。婕納與共和艦隊與 賈格的奇斯中隊攻擊Ylesia並俘虜薩─蘇洛。
亞克博在Treskov星系佈置陷阱，以路克和絕地作為誘餌。一個與奇斯研究遇戰瘋生物的新共和最高秘密情報組織Alpha Blue被揭露，並研發出專對遇戰瘋基因作用的生化武器Alpha Red，預期使用該武器可使遇戰瘋和其生物在三星期內完全滅絕。不過此屠殺方式引發絕地們的強烈抗議而讓該武器未能通過。傑森、婕納等幾位絕地升為絕地武士。新共和艦隊跳到奪取一個舊基地塔金之牙﹝Tarkin's Fang﹞。遇戰瘋帶著全部剩下的voxyn來到Treskov，一面倒地遭眾共和艦隊與走私者聯盟擊敗。落在Ebaq 9地面遇戰瘋的指揮官Tsavong Lah決定以自殺攻擊消滅基地包括婕納在內的絕地。Vergere犧牲自己拯救傑森與傑納，婕納在決鬥中殺死Tsavong。Shimmra對屢次失敗的Nom Anor發出正式格殺令，Nom躲入地下。新的聯邦政府系統成立。
新共和更名為自由聯盟銀河聯邦﹝Galactic Federation of Free Alliances﹞並廣為接受。
Nom科羅森地下遇到一群信仰絕代﹝Jeedai，指絕地﹞救贖的Shame One，並打算以此重建自己勢力，他成為絕代信仰的先知Yu'shaa並以此對遇戰瘋展開報復。Vong偽裝成席─魯克軍隊來到巴庫拉求合，事實上卻意圖佔領此星，不過遭到反抗未得逞。路克出發到奇斯星域尋找活行星Zonama Sekot，Sekot同意協助他們。
實際上是異教徒的Shimmra創造了具有原力的戰士並向其神祇宣戰。Harrar透露數十年前第一次接觸Sekot後取消了入侵此星球的計劃，而Shimmra謀害並篡位前最高指揮官Quoreal繼續此一計劃。他提到了他們的神就是原力，而痛苦是一種與神交會的方法。而他們在成為征服者之後被神放逐離開了家園。
遇戰瘋在攻擊Caluula時遭遇一批由波巴•費特率領的曼道羅力安戰士抵擋。遇戰瘋在蒙•克萊梅利集結五千艦隊準備進攻，聯軍計劃突襲科羅森作為反攻。Shame One拯救三百名囚犯，結果Shimmra屠殺了三千Shame One並下令摧毀蒙•克萊梅利。
韓、莉亞等人在已陷落的Caluula中發現Alpha Red已經被使用，但是此生化武器卻也對一般野生動物有殺傷力，並將散佈到全銀河。當Sekot穿過中星域時路克發現黑暗面的出現。Sekot忽然出現在科羅森旁並發動攻擊，迫使蒙•克萊梅利的 遇戰瘋艦隊拉回。天行者、蘇洛家與一些絕地在Sekot上團聚後前往Contruum。聯軍、海奔和Chiss等所有的艦隊集結在Contruum準備於72小時攻擊科羅森。亞克博在蒙•克萊梅利戰死。
Shimmra認為Sekot的出現是神的對抗，而意圖利用Caluula感染Alpha Red的船隻摧毀Sekot。路克和Harrar到科羅森準備阻止Shimmra毀滅當地。各路聯軍艦隊殺進科羅森，絕地與Shame One聯手對抗遇戰瘋戰士。Sekot被病毒船隻撞擊而開始死亡。傑森以原力說服世界腦選擇生命而非死亡。路克、傑森與婕納等面對Shimmra與遇戰瘋絕地，路克力戰並殺死Shimmra但瀕臨垂死。婕納追擊Shimmra侍臣Onimi時被擊昏並被Onimi帶走。Onimi終於揭露了他是真正最高統帥的身分，並曾因為擁有原力而落為Shame One，結果用原力入侵Shimmra的心智操控他。Onimi宣佈要殺光銀河所有的人，而之前跟上船的傑森以新的原力體認擊敗了Onimi。Nom嘗試最後的欺騙但失敗，遇戰瘋體認到神已棄他們而去。傑森救回路克。
Nas Choka代表遇戰瘋投降。戰爭終於結束，共有365萬億人死亡，無數世界毀滅變更。Sekot化為嶄新的世界Zonama Sekot﹝原 Sekot之子﹞並成為剩餘遇戰瘋的新家，並同意返回未知星域，讓Vong重新創造族群。科羅森的世界腦留下作為承諾。銀河聯盟在科羅森恢復前暫時將首都移到Denon。剩餘的Alpha Red被消滅。路克招集整個銀河的絕地探索新的原力視野。眾人最後聚在卡須克緬懷邱巴卡的事蹟 ……
新絕地學院將被設在Ossus。
當年在
天行者全像紀錄和其他預言、傳奇等被合併為懷爾日誌﹝The Journal of the Whills﹞全像紀錄。
Maw黑洞終於吞噬了凱索星系。
一艘來自星戰宇宙的船在我們的銀河系撞毀，殘骸在宇宙中漂流，其中包括懷爾日誌的複製本。
殘骸漂流而終於墜落地球，掉在加州Modesto市的一位年輕製片喬治•盧卡斯﹝George Lucas﹞家的後院。他秘密翻譯懷爾日誌的內容並計劃拍成電影，花了四五年的時間寫劇本。在聯美﹝United Artists﹞和環球﹝Universal﹞拒絕後，二十世紀福斯﹝20th Century Fox﹞公司同意盧卡斯的計劃。盧卡斯成立光影魔幻特效產業﹝Industrial Light and Magic，ILM﹞來重現全像紀錄的投影效果。
盧卡斯的第一部鉅作上映。
