Se reconocen cuatro escuelas formales de Reiki. Cada una de ellas ofrece su enseñanza en tres niveles aunque existen otras escuelas que ofrecen desde cuatro hasta sieto o más niveles. La primer escuela es llamada REIKI TRADICIONAL. En ella, sobre todo en un principio, el método se dirige sobre todo a la sanación del cuerpo físico. Los costos de cada nivel son elevados y el conocimiento de los símbolos es de carácter secreto. Una diferencia importante es la manera en que se pasan los alineamientos, para cada nivel se hace de forma diferente. Los practicantes poseen un Reiki muy Fuerte. Sus manos generalmente son muy calientes

La otra escuela es la de REIKI ESENCIAL, de Diane Stein. Ella dio más libertad a los practicantes de Reiki e hizo algo que los Maestros de Reiki Tradicional consideran imperdonable, mostró al público los símbolos que eran secretos. En esta escuela, el alumno puede tomar los niveles indiscriminadamente. Sin tener un tiempo pruedencial entre uno y otro. Inclusive, en ocasiones, algunos toman los tres niveles el mismo día, cosa que realmente no permite que la persona viva las experiencias de Reiki I, a parte de las de Reiki II y III. Los símbolos son algo diferentes a los de la escuela tradicional. Hay que anotar que Reiki Esencial surge como una evolución natural. El Reiki de sus practicantes se siente más suave que el de los de Reiki Tradicional, manos tibias, pero funciona de manera igual. Los costos de esta escuela son bajos.

La cuarta y más reciente evolución en Reiki es la escuela de REIKI TRANSPERSONAL. En ella las manos de los practicantes son Calientes, de un Reiki fuerte. En esta escuela se ha retomado lo mejor de las tres escuelas anteriores y se han agregado nuevos ingredientes. Los símbolos son semiprivados, lo que significa que si se pueden dar a conocer pero bajo ciertas normas de ética. Los practicantes de Reiki Transpersonal notan una mayor conciencia, un despertar más claro de facultades Psíquicas, una mayor conexión con sus pacientes. Aquí los niveles de Reiki no se otorgan de buenas a primeras. El Reiki I, que quiera pasar a Reiki II, debe haber tenido un período de práctica y experiencias de al menos 3 meses, que es un tiempo prudencial. Esta regla es debido a que en cada nivel se reciben alineamientos que promueven modificaciones y mejoras en la vida del sanador. Una mejor manera de verlos es la de dejar pasar un tiempo, para diferenciar entre las experiencias otorgadas por cada nivel. Para tomar el tercer nivel, el de maestro, el sanador debe dominar bien los símbolos y sus variantes. Debe acreditar una experiencia de otros 3 meses. A los alumnos, sanadores, de todos los niveles, se les hace un seguimiento y se mantiene sobre ellos una permanente asesoría. Se están creando centros para que realicen prácticas, de manera gratuita, como si se diera un diezmo de Reiki. Se ponen todos los alineamientos de Reiki Tradicional y los de las otras escuelas en cada nivel. Sus costos son bajos.