Story:

"Die Erde im Jahr 2065. Zerstörung und Verwirrung herrscht um uns. Städte sind vernichtet, die Bevölkerung wurde dezimiert und die wenigen Menschen die noch existieren müssen einen Weg finden zu überleben. In dieser Welt müssen wir dem Tod gegenübertreten und uns von unseren Liebsten trennen. Wir beginnen uns zu fragen, was "Leben" und "Liebe" ist, und welche philosophische Bedeutung das Wort "Herz" hat. Nach allem was in dieser Welt passiert ist, hat die Wissenschaft Leben und Tod analysiert und Leben als eine Form der Energie beschrieben.Jenseits der fesselnden Kämpfe wird Sie Final Fantasy auf eine Reise der persönlichen Erforschung in der wirklichen und in der Fantasy Welt führen, tief hinein in seine Charakteristik und Themen: Liebe, Freundschaft, Träume, Abenteuer, Leben und ... Tod"

Der Film beginnt mit einem Traum. Eine junge Frau blickt in eine öde Landschaft. Etwas grollt in der Ferne, zuerst leise, dann mit zunehmend ohrenbetäubender Intensität. Bevor die Quelle dieses Geräuschs herbeieilt und über sie herfällt, erwacht die Frau. Ihr Name ist Aki, und sie hat diesen Traum immer und immer wieder, während sie in ihrem Space Shuttle um den Erdorbit kreist. Obwohl sie nicht weiß, was der Traum bedeutet, glaubt sie, daß sie die Antwort auf der Oberfläche des Planeten finden kann... den sie zuvor jedoch retten muss.

New, York, der Times Square. Aki durchsucht die Trümmer und den Dreck, die einmal eine große Stadt darstellten. Sie führt einen kleinen Scanner bei sich und sucht damit nach etwas, was der "sechste Geist" genannt wird. Während sie sich auf ihre Arbeit konzentriert, wird sie langsam von "scheußlich asymmetrischen, durchscheinenden Kreaturen mit enorm großen Hirnen und Tentakelarmen" eingekreist. Die Geisterkreaturen sind die "Phantome", und sie sind alles andere als freundlich gesinnt. Plötzlich kommt jedoch ein blendendes Licht von oben, und ein Truppentransporter der DEEP EYES spuckt eine Ladung Soldaten aus. Sie eröffnen das Feuer auf die Phantome und pulverisieren sie mit Salven von elektrischen Entladungen. Der Anführer der Einheit versucht, Aki auf das Schiff bringen, aber sie blickt auf ihren Scanner und läuft davon. Die DEEP EYES verfolgen sie durch die Ruinen. Sie besteht darauf, daß in der Stadt eine Lebensform existiert, und sie wird nicht gehen, bevor sie diese gefunden hat. Schließlich findet sie, wonach sie gesucht hat: Ein kleines Unkraut, das in einer Mauerritze wächst. Während sie es in einen Behälter überführt, steigen Phantome aus dem Boden und durch die angrenzenden Wände. Die Soldaten schießen verzweifelt um sich, aber es sind einfach zu viele. Wieder kommt das blendende Licht; das Transportschiff hat sie noch einmal gefunden. Die Soldaten klettern schnell aus den Ruinen heraus und in den Transporter, gerade bevor die Phantome sie kriegen.

An Bord des Schiffs nehmen die DEEP EYES zum ersten Mal ihre Helme ab. Neil (Steve Buscemi) ist ein Spaßvogel, der nie irgendetwas ernst nimmt. Jane (Peri Gilpin) ist eine draufgängerische Soldatin, die etwas unsicher wegen ihres Geschlechts ist (vergleichbar mit Vasquez in Alien). Der dritte Soldat ist Ryan (Ving Rhames), der kaum weniger sarkastisch ist als Neil. Der Anführer nimmt seinen Helm zunächst nicht ab, aber als Aki ihn darauf anspricht, entpuppt er sich als Gray (Alec Baldwin). Aki erkennt ihn natürlich und ist ziemlich geschockt, ihn zu sehen. [Anm. d. Übersetzers: Anscheinend waren die beiden irgendwie liiert, in dem Review wird später darauf eingangen]

Beim Betreten von Barrier City (einer Stadt, die durch eine Energiebarriere vor den Phantomen geschützt wird) wird während einer Sicherheitsüberprüfung festgestellt, daß Gray mit einem Phantom in Berührung gekommen ist. Das reicht aus, um einen Menschen zu infizieren: Ein Kontakt, und du bist tot, genau wie alle um dich herum. Gray wird in einer Quarantäne-Röhre durch das Stadttor transportiert, aber seine Freunde zerren ihn heraus und Aki schnallt ihn an einen nahestehenden Operationstisch (in der Nähe des Stadttors befinden sich Notaufnahmeräume, um ankommende infizierte Menschen zu retten). Gray hat weniger als drei Minuten zu leben, als Aki damit beginnt, die Verseuchung mit einem Laser aus seinem Körper zu brennen. Gray kommt gerade noch durch.

Als sich die Aufregung gelegt hat, versuchen die Sicherheitstechniker Aki auf eine mögliche Verseuchung hin zu scannen, aber Dr. Sid (James Woods) erscheint und schleust sie ohne Untersuchung in die Stadt. Sie begeben sich in ein Labor, wo sie den "Geist" aus der Pflanze entnehmen und ihn mit fünf anderen "Geistern" verschmelzen. Sie betrachten das Energiemuster der sechs Geister, und es entspricht fast genau einer anderen Anzeige: dem Energiemuster eines Phantomgeistes. Dies gefällt ihnen, und Aki verlässt den Raum. Sid empfiehlt ihr, von Gray fernzubleiben oder zumindest keine Affäre mit ihm zu beginnen. Man erhält den Eindruck, daß die beiden schon einmal zusammen waren.

Aki träumt wieder, und diesmal ertönt das Grollen, als zwei Armeen von Geistern aufeinander prallen.

Der Versammlungsraum. Tag. General Hein (Donald Sutherland) versucht, den Rat davon zu überzeugen, die "Zeus", eine gewaltige Weltraum-Energiekanone einzusetzen, um die Phantome an ihrer Ursprungsstätte zu treffen: einem Meteor, der im Jahre 2031 auf der Erde einschlug. Dr. Sid erhebt sich und erklärt, daß die Zeus in der Tat die Phantome ausrotten werde, daß aber die Gefahr bestehe, die "Gaia", der Geist der Erde, könne dabei zerstört werden. Der Rat lacht angesichts der Vorstellung, die Erde könne über eine Seele verfügen. Sid ignoriert das Gelächter und enthüllt seinen Plan: Durch das Sammeln der Geister von Erdkreaturen könnte er eine Energie erschaffen, die das genaue Gegenteil der Phantom-Energie ist. Diese könnte dazu verwendet werden, die Phantome "auszugleichen". Der Rat ist skeptisch, aber Aki platzt herein und erklärt, sie habe Beweise: Ein tödlich kranker Patient sei in der Lage gewesen, die Verseuchung zu überleben, obwohl er noch nicht geheilt sei. Dann zeigt sie, daß ihr Brustkorb von einem metallischen Gerät umhüllt ist. Sie schaltet einen Bildschirm ein und enthüllt, daß sie selbst der tödliche erkrankte Patient ist. Ihr Körper ist durch und durch verseucht, aber durch die Energie in ihrer mechansichen Brustplatte wird sie am Leben erhalten. Gray, der im Hintergrund sitzt, zeigt keine Gefühlsregung.

Später an diesem Abend setzt Aki ihre Suche fort, diesmal von einer Seilbahn aus, die über der Barriere von New York schwebt. Gray taucht auf und bietet an, mit ihr zu gehen, aber Aki ignoriert ihn. Ryan und Neil versuchen vom Boden aus, eine romantische Atmosphäre zu erzeugen, indem sie einige Drähte manipulieren und Aki und Gray über der Stadt zum Stehen bringen. Gray spricht von der Vergangenheit, wie Aki damals verschwand, ohne sich zu verabschieden, und Aki erzählt ihm, wie sie infiziert wurde und dann Geister gesammelt hat. Gray wird ganz romantisch, und die beiden genießen einen rührenden Moment, der plötzlich unterbrochen wird, als sich die Seilbahn wieder in Bewegung setzt.

Hein ruft Gray in sein Büro und trägt den DEEP EYES auf, Aki auf abweichendes Verhalten hin zu überwachen. Er ist besorgt, daß die Phantome Kontrolle über sie ausüben könnten. Als guter Soldat stimmt Gray zu.

Aki träumt wieder von der Schlacht, aber diesmal hört die Schlacht plötzlich auf und alle Aliens wenden sich ihr zu. Sie dreht sich um und schreit. Als sie erwacht, kommt sie zu dem Schluß, daß die Verseuchung in ihr die Oberhand gewinnt.

Aki, die DEEP EYES und einige andere Soldaten fliegen über ein Schlachtfeld, auf dem die Menschheit einst gegen die Phantome gekämpft hat. Sie landen und finden schnell den gesuchten "siebten Geist"- ein Energiepack bei der Leiche eines toten Soldaten. Sie schnappen es sich und wollen gehen, aber die Phantome haben sie umzingelt. Sie laufen so schnell wie möglich zum Schiff, und Aki wird ohnmächtig. Als sie versuchen, abzuheben, erkennt Neil, daß ein riesiges spinnenartiges Phantom auf dem Schiff herumturnt. Er fliegt ein paar schmucke Manöver über dem Schlachtfeld (coole Actionsequenz). Unterdessen wenden sich hinten im Schiff die namenlosen Soldaten an Grey und verlangen, die Obhut über Aki zu erhalten. Aki träumt wieder und sieht diesmal, wovor sie sich letztes mal abgewendet hat: Eine Feuerwand, die das Schlachtfeld der Aliens überschwemmt. Sie erwacht mit einem Schrei, und ein überraschter Soldat schießt im Affekt auf sie. Die DEEP EYES greifen an, doch der Soldat gelangt an sein Waffe. Gerade in diesem Moment fliegt Neil das Schiff durch das Bein eines Riesenphantoms. Das Geisterbein zieht durch die Kabine und gebau durch den Soldaten, der augenblicklich stirbt.

Zurück in Barrier City: Sid und Gray arbeiten daran, den siebten Geist direkt in Akis Körper einzubauen, um sie am Leben zu erhalten. Gray gelangt dabei in Akis Traum, und die beiden erleben das endgültige Schicksal des außerirdischen Planeten. Gerade als die Operation beendet ist, stürmen Heins Männer den Raum und nehmen Aki, Sid und die DEEP EYES fest. Sids Labor haben sie schon zerstört. Dann schaltet Hein einen Teil der Energiebarriere ab, damit die Phantome enige Stadtgebiete stürmen können. Er will es so erscheinen lassen, daß die Barriere versagt hat, damit der Rat ihm erlaubt, die Zeus-Kanone einzusetzen. Im Gefängnis enthüllt Aki unterdessen, was der Meteor wirklich ist und worum es sich bei den Phantomen wirklich handelt. Hein und seine Männer sehen zu, wie die Phantome den freigegebenen Sektor der Stadt überfallen. Aber halt! Auch in einem anderen Sektor werden jetzt Phantome gesichtet. Sie breiten sich überall aus! Als Hein und seine Leute verzweifelt nach einer Erklärung suchen, halten sie alle plötzlich ein und blicken nach oben... auf die großen Rohre an der Decke, die alle Gebäude der Stadt miteinander verbinden...