La isla de Puerto Rico es la más oriental y pequeña de las Antillas Mayores. Además de la principal, el Estado Libre Asociado incluye las islas de Vieques, Culebra y Mona, así como varios islotes.

La Cordillera Central se extiende por el interior de la isla, y hacie el Noreste está la Sierra de Luquillo. La altura máxima del país es Cerro Punta (1,336 m).

La vegetación original es escasa; los bosques han retrocedido ante las continuas roturaciones que se han realizado para extender las zonas agrícolas. Actualmente sólo hay bosques residuales de tipo tropical en la vertiente septentrional de la Cordillera Central y de caducifolios en las vertientes meridionales. La vida silvestre se compone principalmente de pequeños reptiles y pájaros.

De las 1,200 corrientes de agua que hay en Puerto Rico, apenas 50 se clasifican como ríos. La Cordillera Central divide las vertientes Norte o Atlántica y Sur o del Caribe. La primera presenta ríos más largos, caudalosos y tranquilos que la segunda. Abundan las corrientes subterráneas, especialmente al Noroeste. Entre las fuentes termales más importantes figuran los Baños de Coamo, de aguas sulfurosas, a unos 25 km. de Ponce. Al Norte y al Sur de la isla, las profundidades marinas alcanzan 8,648 m (Fosa de Puerto Rico) y 5,000 m (Fosa de Tanner).

El clima es de tipo marítimo-tropical, benigno y con temperaturas muy regulares (media anual en la costa y tierras bajas: 25°C). En las tierras altas del interior la temperatura fluctúa entre 19°C y 24°C. Los vientos alisios que soplan del Este moderan las calores. La paisaje y su clima atraen al turismo internacional.